Pular para o conteúdo
Genomahcov - FiocruzGenomahcov - Fiocruz
Genomahcov – Fiocruz
Genomahcov – Fiocruz
  • Português
  • English
  • Español
  • Português
  • English
  • Español

Publicações

Trabalho científico preliminar da Rede Genômica Fiocruz discute a prevalência da variante Delta no Amazonas, onde ela substituiu outras variantes como a Gama e a Mu

O princípio do ano de 2021 viu a situação da pandemia de COVID-19 se agravar no Brasil. Em especial, no estado do Amazonas, o avanço da pandemia teve dominância característica da Variante de Preocupação (VOC) Gama, também conhecida como P.1. Mais recentemente, conforme apontado por pesquisas conduzidas pela Rede Genômica Fiocruz (pre-print), variantes derivadas da Gama continuaram a se espalhar e acumular novas mutações — incluindo alterações na Glicoproteína Spike com possível efeito de potencialização do contágio, como deleções no domínio N-Terminal (NTD; associadas à evasão da ação de anticorpos e à capacidade de causar reinfecção ou escape vacinal) ou alterações estruturais na junção S1/S2 (associadas a uma invasão celular mais eficiente). A estas variantes da Linhagem P.1 deu-se o nome de Gama+, e sua transmissão no estado do Amazonas e eventual espalhamento para outros estados foi objeto de preocupação de especialistas e autoridades.

Com a chegada ao Brasil de outra VOC, a Delta (B.1.617.2, inicialmente detectada na Península Índica), paralelamente à preocupação com o estabelecimento e dominância das amostras derivadas da VOC Gama, corria também a hipótese de que o espalhamento e a dominância das mesmas no cenário epidemiológico fosse o bastante para frear o espalhamento da Delta.

No presente post, publicado no fórum de especialistas em virologia Virological.Org, pesquisadores da Rede Genômica Fiocruz relatam os resultados da análise de 1132 genomas completos de SARS-CoV-2 isolados de amostras clínicas de pacientes, coletadas entre 1º de Julho e 15 de Outubro de 2021 — amostragem correspondente a 4,5% dos casos confirmados no estado para o período. A vigilância genômica permitiu observar uma queda abrupta na prevalência de amostras da VOC Gama e Gama+, assim como um aumento na prevalência da VOC Delta, que passou de 1% da totalidade de amostras em Julho para 89% em Outubro. Durante este período, ocorreu também a introdução da VOI Mu (B.1.621, inicialmente detectada na Colômbia) no estado, embora esta tenha permanecido com uma baixa prevalência de acordo com a amostragem da Rede (menos de 1% das amostras entre Agosto e Setembro, e não detectada em Outubro). É importante notar que o espalhamento da VOC Delta ocorreu em um período no qual o número total de casos no Amazonas decresceu, provavelmente devido à combinação das barreiras imunológicas naturais e vacinais (barreira imunológica híbrida).

Ainda assim, os resultados indicam que a VOC Delta teve a capacidade de substituir, por competição ecológica, as variantes Gama, Gama+ e Mu no estado do Amazonas, mesmo levando em conta que esta Unidade Federativa corresponde a uma das localidades do mundo com uma das maiores barreiras imunológicas híbridas.

Naveca, F. G., Nascimento, V., Souza, V., Corado, A. L., Nascimento, F., Mejía, M., Brandão, M. J., Silva, A. V., Benzaken, A. S., Silva, G., Gonçalves, L., Luz, S. L. B., Cortés, J. J. C., Nieto, J. C. G., Vesga, K. N. R., Fernandes, C., Amorim, T., Mattos, T., Abdalla, L., Santos, J. H., Wallau, G. L., Delatorre, E., Arantes, I., Siqueira, M. M., Resende, P. C., Gräf, T. & Bello, G. The SARS-CoV-2 variant Delta displaced the variants Gamma and Gamma plus in Amazonas, Brazil

Disponível em Virological.Org

Categoria: 2021, Posts Virological.org, Publicações26 de outubro de 2021
Marcações: Dinâmica EpidemiológicaSARS-CoV-2VariantesVigilância GenômicaVOC Delta

Navegação de post:

AnteriorPost anterior:Estudo de caso de paciente vacinado reinfectado com variante Gama aponta para a importância de esquemas com mais de uma plataforma de vacinaPróximoPróximo post:Carta aos editores do periódico Journal of Infection contribui com a compreensão do cenário da VOC Gama (P.1) no Brasil pela comunidade internacional

Relacionadas

Artigo da Rede Genômica Fiocruz recém-publicado investiga como o genótipo “Cosmopolita” do vírus da dengue sorotipo 2 se estabeleceu no Brasil desde sua introdução no país
28 de setembro de 2023
Pesquisadores da Fiocruz associados à Rede Genômica e à REMONAR do MCTI avaliam a persistência da bactéria Elizabethkingia anophelis multirresistente em efluentes industriais
15 de setembro de 2023
Artigo com colaboração da Rede Genômica aborda o cenário de reinfecções pelo SARS-CoV-2 no Brasil entre 2020 e 2022
12 de agosto de 2023
Colaboração entre a Rede Genômica Fiocruz e a UFF leva à descrição de uma linhagem de Enterococcus faecalis ST21 multirresistente em amostras de Estação de Tratamento de Efluentes
5 de agosto de 2023
Publicado no periódico The Lancet, um dos maiores do mundo, um artigo de comentário sobre a vigilância global de arboviroses
1 de agosto de 2023
Pesquisadores afiliados à Rede Genômica investigam a presença de bactérias multirresistentes da espécie Klebsiella pneumoniae em estações de tratamento de efluentes
28 de junho de 2023
Últimas Publicações
  • Artigo da Rede Genômica Fiocruz recém-publicado investiga como o genótipo “Cosmopolita” do vírus da dengue sorotipo 2 se estabeleceu no Brasil desde sua introdução no país
  • Pesquisadores da Fiocruz associados à Rede Genômica e à REMONAR do MCTI avaliam a persistência da bactéria Elizabethkingia anophelis multirresistente em efluentes industriais
  • Rede Genômica Fiocruz investiga expansão do chikungunya no RS
  • Artigo com colaboração da Rede Genômica aborda o cenário de reinfecções pelo SARS-CoV-2 no Brasil entre 2020 e 2022
  • Colaboração entre a Rede Genômica Fiocruz e a UFF leva à descrição de uma linhagem de Enterococcus faecalis ST21 multirresistente em amostras de Estação de Tratamento de Efluentes
  • Publicado no periódico The Lancet, um dos maiores do mundo, um artigo de comentário sobre a vigilância global de arboviroses
  • Pesquisadores afiliados à Rede Genômica investigam a presença de bactérias multirresistentes da espécie Klebsiella pneumoniae em estações de tratamento de efluentes
  • Estudo da Fiocruz revela novo genótipo do vírus da dengue na Bahia

genomahcov@fiocruz.br

Av. Brasil, 4365 – Manguinhos, Rio de Janeiro

GISAID data provided on this website are subject to GISAID’s Terms and Conditions

Genomahcov - Fiocruz
Web Design e Produtor Multimídia: Wagner Nagib - ASCOM - Fiocruz Paraná
Divulgação científica e produção de conteúdo: Bruno de Sousa Moraes (Bolsista VPPCB)
Suporte Técnico: Rafael Ferreira - Rafael Ferreira Plataforma de Bioinformática RJ (RPT04A)
Leandro Ribeiro – Vice-Presidência de Pesquisa e Coleções Biológicas