N9: Identificada pela primeira vez entre 2020 e o início de 2021 uma nova variante do SARS-CoV-2, em amostras de dez estados brasileiros
A pandemia do SARS-CoV-2 no Brasil foi dominada por duas linhagens principais ao longo de 2020 e o princípio de 2021. Dentre estas linhagens, a B.1.1.28 já deu origem a duas importantes variantes que carregam mutações na glicoproteína Spike (proteína S) como a substituição de aminoácidos E484K no domínio de ligação ao receptor (RBD), implicada como um dos principais fatores para o escape da neutralização por anticorpos contra o vírus. Estas linhagens são a variante de interesse P.2 e a variante de preocupação (VOC) Gama. A Gama, provavelmente surgida em dezembro de 2020, se espalhou rapidamente pelo estado do Amazonas e alcançou outras regiões do país, e possui mutações adicionais que parecem conferir à variante uma capacidade aumentada de causar reinfecções, e maiores cargas virais em pacientes.
Este artigo é resultado do processo de revisão independente e editoração da publicação originalmente postada no fórum de discussão de pesquisas em virologia Virological.Org, que descreveu a primeira variante brasileira positiva para a mutação E484K derivada da linhagem B.1.1.33, a outra linhagem dominante no Brasil. A VOI N.9 provavelmente surgiu em agosto de 2020, e sua descoberta a partir de amostras de dez estados (São Paulo, Santa Catarina, Amazonas, Pará, Bahia, Maranhão, Paraíba, Pernambuco, Piauí e Sergipe) coletadas entre novembro de 2020 e fevereiro de 2021 evidencia seu rápido espalhamento pelo território nacional, reflexo de uma dificuldade em garantir o isolamento e distanciamento sociais e conter o fluxo de pessoas entre diferentes regiões brasileiras. Apesar deste espalhamento rápido, a N.9 parece ter uma baixa prevalência, correspondendo a aproximadamente 3% das amostras em escala nacional. Além de carregar a mutação E484K na proteína S, a N.9 possui ainda outras quatro mutações não-sinônimas que definem a linhagem.
Resende PC, Gräf T, Paixão ACD, Appolinario L, Lopes RS, Mendonça ACdF, da Rocha ASB, Motta FC, Neto LGL, Khouri R, de Oliveira CI, Santos-Muccillo P, Bezerra JF, Teixeira DLF, Riediger I, Debur MdC, Ribeiro-Rodrigues R, Leite AB, do Santos CA, Gregianini TS, Fernandes SB, Bernardes AFL, Cavalcanti AC, Miyajima F, Sachhi C, Mattos T, da Costa CF, Delatorre E, Wallau GL, Naveca FG, Bello G, Siqueira MM. A Potential SARS-CoV-2 Variant of Interest (VOI) Harboring Mutation E484K in the Spike Protein Was Identified within Lineage B.1.1.33 Circulating in Brazil.
