Trabalho de pesquisa envolvendo membros da Rede Genômica Fiocruz caracteriza o genoma da Recombinante XAG
Um dos fenômenos recentemente caracterizados pela continuada vigilância genômica do novo coronavírus pandêmico SARS-CoV-2 é o surgimento de linhagens recombinantes. Estas recombinantes, fruto da combinação de partes do genoma de duas ou mais linhagens do SARS-CoV-2, representam um mecanismo adicional de geração de diversidade do vírus. Isto porque, ao combinar características de duas linhagens diferentes, as recombinantes podem ter alterações em seu fenótipo, ou seja: em suas características biológicas. Especialmente levando em conta que a evolução do vírus — em um cenário composto por diferentes hospedeiros e graus de imunização — selecionou Variantes de Preocupação (VOCs) com uma combinação de mutações em genes importantes que proporcionam um escape parcial de mecanismos imunes como anticorpos, esta combinação de diferentes características genéticas apresenta um potencial risco à saúde pública.
O trabalho de pesquisa ao qual este resumo se refere é o primeiro a caracterizar molecularmente a recombinante XAG, detectada pela primeira vez em território brasileiro e fruto da combinação entre os genomas das linhagens Ômicron BA.1.1 e BA.2.23. O artigo detalha o quanto a confirmação de uma recombinante é um processo complexo que necessita uma curadoria manual por parte de bioinformatas e especialistas em genômica experientes, uma vez que há necessidade de se confirmar se o que está sendo observado no sequenciamento é de fato um genoma recombinante ou apenas uma co-detecção ou contaminação de amostras.
O artigo caracterizou quatro mutações que ainda não haviam sido descritas em nenhuma recombinante identificada até o momento, e descreveu os possíveis pontos de quebra — regiões do genoma mais provavelmente fruto da junção dos fragmentos de genomas da BA.1.1 e BA.2.23. O estudo trata ainda das sequências associadas à linhagem já detectadas no Brasil (186 sequências em 10 estados) e no mundo (incluindo países como Argentina, Áustria, Canadá, Chile, Colômbia, Dinamarca, França, Alemanha, Índia, Israel, Japão, Luxemburgo, México, Nova Zelândia, Peru, Portugal, Escócia, Suíça e Estados Unidos). O número de sequências depositadas na plataforma GISAID para estudo pela comunidade internacional era de 819 sequências até a publicação do artigo.
O estudo ressalta a importância de uma vigilância genômica consistente que permita monitorar o surgimento e a evolução de recombinantes como estas, especialmente frente ao risco de recombinantes entre linhagens do vírus capazes de infectar animais e seres humanos.
de Souza Silva, T., Salvato, R. S., Gregianini, T. S., Gomes, I. A., Pereira, E. C., de Oliveira, E., Menezes, A. L., Barcellos, R. B., Godinho, F. M., Riediger, I., Debur, M. C., Oliveira, C. M., Ribeiro-Rodrigues, R., Miyajima, F., Dias, F. S., Abbud, A., Monte-Neto, R., Calzavara-Silva, C. E., Siqueira, M. M., Wallau, G. L., Resende, P. C., Fernandes, G. R. & Alves, P. (2022). Molecular characterization of a new SARS-CoV-2 recombinant cluster XAG identified in Brazil.
